Program studiów doktoranckich w dziedzinie informatyki i nauk obliczeniowych ma na celu wyszkolenie wysoko wykwalifikowanych ekspertów zdolnych do dalszego rozwoju swojej dziedziny poprzez znajdowanie nowych oryginalnych rozwiązań, metod i procedur oraz stosowanie najbardziej wymagających znanych technik. Studenci mogą profilować się w wielu różnych dziedzinach, takich jak informatyka, wizja komputerowa, uczenie maszynowe, sztuczna inteligencja, obliczenia HPC, chemia obliczeniowa, nanorobotyka i wiele innych.

Program studiów doktoranckich Dydaktyka Matematyki koncentruje się na przygotowaniu naukowców i pracowników koncepcyjnych posiadających kompetencje do prowadzenia badań naukowych w zakresie dydaktyki matematyki oraz analizy i oceny treści programowych programów nauczania, w tym uczelni kształcących nauczycieli. Kierunek Dydaktyka Matematyki obejmuje głównie dziedziny matematyki, pedagogiki, dydaktyki ogólnej i psychologii. Program bez specjalizacji.

Kierunek Inżynieria Matematyczna ma charakter interdyscyplinarny, ponieważ łączy teoretyczną wiedzę matematyczną z wielu dziedzin nauk przyrodniczych i inżynierskich oraz stosuje ją do modelowania matematycznego procesów zachodzących w przyrodzie, inżynierii i ochronie środowiska.